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邓攀
北京中关村学院导师
邓攀博士，北京中关村学院资深研究员。2012年毕业于清华大学生命科学学院，入选第四届“科技创新，星火燎原”清华大学学生创新人才培养计划，获得理学学士学位。2018年博士毕业于美国康奈尔大学/纪念斯隆-凯特琳癌症研究中心细胞与分子生物学专业。曾任微软研究院高级研究员。研究方向为基于人工智能的系统生物学与合成生物学，致力于利用人工智能技术解析基础生物机制，加速药物发现。曾在Molecular Cell, Nature Cell Biology, Nature Machine Intelligence, PNAS 等期刊发表十余篇论文。
人物经历
研究方向
1. 细胞命运理解与操控
2. 计算合成生物学
3. AI 制药
代表性学术论文
Wang T, Pan Y, Ju F, Zheng S, Liu C, Min Y, Liu X, Xia H, Liu G, Liu H, Deng P. Directing cellular transitions on gene graph-enhanced cell state manifold. Nature Cell Biology. 2025
Sun H, He L, Deng P, Liu G, Zhao Z, Jiang Y, Cao C, Ju F, Wu L, Liu H, Qin T, Liu T. Accelerating protein engineering with fitness landscape modeling and reinforcement learning. In Press at Nature Machine Intelligence.
Ma M, Liu G, Cao C, Deng P, Dao T, Gu A, Jin P, Yang Z, Xia Y, Luo R, Hu P, Wang Z, Chen Y, Liu H, Qin T. HybriDNA: A Hybrid Transformer-Mamba2 Long-Range DNA Language Model. ICLR Workshop. 2025
Xia Y, Wu K, Deng P, Liu R, Zhang Y, Guo H, Cui Y, Pei Q, Wu L, Xie S, Chen S. Target-aware Molecule Generation for Drug Design Using a Chemical Language Model. Nature Communications 15.1 (2024): 9360.
Li Y, Ju F, Chen Z, Qu Y, Xia H, He L, Wu L, Zhu J, Shao B, Deng P. CREaTor: zero-shot cis-regulatory pattern modeling with attention mechanisms. Genome Biology. 2023 Nov 23;24(1):266.